Towani一家乘坐的星际巡洋舰在恩多卫星上坠毁了。Towani家的爸爸和妈妈和他们的两个孩子Mace与Cindel失散了。伊渥克族人——恩多卫星上的土著——找到了这两个孩子。尽管孩子们与伊渥克族的交流起初非常困难，Mace和Cindel最终还是说服了伊渥克族人帮助找寻他们的父母。
一位女律师穿越时空，与历史上为妇女权利而奋斗的其他女性相遇。
故事发生在第一部的四年之后，此时特警K（汤姆•李•琼斯 饰）已经退休，成为一名普通的邮局局长，而J（威尔•史密斯 饰）则继续从事MIB的工作。
叙利亚沙漠中，女吸血鬼丹尼卡（Parker Posey 饰）带领一队同类，深入古老的沙漠宫殿，意欲唤醒沉睡的吸血鬼之王——德雷克（Dominic Purcell 饰）。夜色中，刀锋（韦斯利•斯奈普斯 Wesley Snipes 饰）仍然与吸血鬼们进行着无休止的战斗，但他很快落入了丹尼卡的圈套，误杀了一名人类，因此被FBI探员威尔逊等人抓捕。与此同时，刀锋的老搭档惠斯勒之女阿比盖尔（Jessica Biel 饰）同汉尼拔金（Ryan Reynolds 饰）等年轻人秉持与刀锋相近的信念，组成了一支以自身为诱饵来消灭吸血鬼的队伍，他们将刀锋从FBI和丹尼卡手中救出，但后者对他们的胆大妄为嗤之以鼻，然而面对强大的吸血鬼王德雷克，他们不得不并肩作战……
